Lietuvos Respublikos liberalų sąjūdžio Panevėžio miesto skyrius buvo įsteigtas 2006 m. kovo 23 d. Steigiamajame susirinkime dalyvavo ir už skyriaus įsteigimą balsavo 23 iniciatyvinės grupės nariai. Susirinkime buvo priimti skyriaus nuostatai, išrinkta 10 narių taryba, skyriaus pirmininkas, jo pavaduotojai, skyriaus sekretorius ir kontrolės komisija. Skyriaus pirmininku išrinktas Darius Grigonis.
2007 m. skyrius dalyvavo savivaldybių tarybų rinkimuose. Į Panevėžio miesto savivaldybės tarybos rinkimus iškėlėme 22 kandidatus, tarp kurių buvo ir 5 nepriklausantys liberalų sąjūdžiui, bet liberalų sąjūdžio programai pritariantys panevėžiečiai. Du liberalų sąjūdžio sąrašo kandidatai pateko į miesto savivaldybės tarybą.
2011 m. savivaldybių tarybų rinkimuose vėl subūrėme 22 kandidatų komandą. Rinkėjai suteikė net trims sąrašo kandidatams pasitikėjimo mandatus – Zitai Kukuraitienei, Laimučiui Sėdžiui ir Gintarui Šileikiui. Liberalų sąjūdžio atstovai dalyvavo formuojant daugumą, o Gintaras Šileikis buvo išrinktas mero pavaduotoju. 2011 m. gruodžio mėn. Panevėžio miesto taryboje susiformavo naujoji dauguma kurios sudaryme Liberalų sąjūdžio atstovai nedalyvavo.
Šiuo metu skyriuje yra 97 nariai. Nuo 2011 kovo skyriui vadovauja Raimundas Povilonis.